La plupart des gisements de métaux, y compris ceux du Québec, ont une origine magmatique. Les modèles génétiques, essentiels à l'exploration, sont encore débattus, notamment à propos des processus de transport concentrant ces métaux en gisements exploitables. Ce thème porte sur la genèse des dépôts métalliques dans les systèmes volcaniques et leur transport par les fluides hydrothermaux (gaz, saumures, etc.). Le Geotop développe une expertise unique, à cheval entre la pétrologie et la géochimie isotopique (éléments en traces, gaz rares), et combinant études sur le terrain et expérimentation en laboratoire. Le travail de terrain, qui dans les prochaines années se concentrera en Amérique du sud et en Asie, vise à comprendre les systèmes volcaniques et hydrothermaux modernes, ceux-ci étant des analogues des milieux de formation passés (comme en Abitibi) des gisements épithermaux. L'expérimentation permet quant à elle de tester des hypothèses sur les processus de transport des métaux.