Les activités anthropiques et les changements climatiques qui en découlent ont une multitude d'impacts qui touchent directement le Québec. Les expertises combinées des membres du Geotop permettent d'aborder ces questions et de contribuer aux initiatives gouvernementales en environnement. Des études sont menées en milieu continental (e.g., stocks de carbone dans les milieux boréaux, risques de faible hydraulicité dans les bassins hydroélectriques), ainsi qu'en milieu côtier dans le cadre des travaux de la Stratégie maritime et de l'Institut nordique du Québec (hypoxie et acidification du Saint-Laurent et impacts sur les écosystèmes estuariens; érosion côtière face aux variations de niveau de la mer et du couvert de glace de mer). Au cours des prochaines années, des études intégrées seront réalisées, notamment sur les côtes du Québec-Labrador, pour mieux comprendre les interactions continent-océan-atmosphère et contribuer à améliorer les modèles climatiques.